Nastak Muzeja Matija Skurjeni počiva na prvom ugovoru između Matje Skurjenija i Skupštine općine Zaprešić (u daljnjem tekstu grad Zaprešić) potpisan 2.7.1984.g.
Inicijator ovog darovnog ugovora je naivni umjetnik Matija Skurjeni i profesorica Milka Kobešćak, dugogodišnja suradnica slikara.
Stručni autor koncepcije galerije, njenog stalnog postava i vodiča je Vladimir Maleković ugledni likovni kritičar i dugogodišnji ravnatelj Muzeja za umjetnost i obrt u Zagrebu.
U Novim Dvorima u Zaprešiću otvorena je Galerija Matija Skurjeni 15.7.1987.g. i priključena Narodnom sveučilištu u čijem sastavu je bio i Muzej Brdovec. Iste godine je Matija Skurjeni proglašen počesnim građaninom Zaprešića.
Profesorica Milka Kobeščak 2000.g. posmrtno daruje svoju kolekciju slika, crteža i grafika Gradu Zaprešiću i galeriji Skurjeni kako bi se obogatio fundus.
Galerija Skurjeni djeluje u sastavu muzeja Brdovec do 2000.g.
Na prijedlog grada Zaprešića od Ministarstva kulture traži se suglasnost o osnivanju Muzeja Matija Skurjeni sa stalnim postavom. Prijedlog koncepcije sastavio je Mario Lenković, muzejski savjetnik .
20.11.2000.g. Ministarstvo je prihvatilo prijedloge i suglasnost Muzejskog vijeća, te odobrilo prerastanje Galerije Matija Skurjeni u Muzej Matija Skurjeni sa stalnim postavom (koji obuhvaća cjelokupni stvaralački opus Matije Skurjenija; počevši sa najranijim radovima sve do posljednijih djela) i muzejskim vodičom .
U muzeju se mogu razgledati najznačajniji radovi Matije Skurjenija: slike-ulja na platnu, crteži i grafike.